そういえば

各ウィンドウに「常に手前に表示する」オプションがあればいいですよね。
結構そういう機能のついたWindowswソフト多いんでできるんじゃないですかね。
ちなみにnvidiaのビデオカードのドライバにそういう機能がありますがShadeのウィンドウには利かないです。